5-羟甲基胞嘧啶修饰在HBV相关肝癌中的表达及意义

作者：李月翠^*; 胡伟跃; 李成行; 张莉莉; 徐象威; 李进; 骆红霞

来源：哈尔滨医科大学学报, 2023, 57(03): 264-270.

DOI：10.20010/j.issn.1000-1905.2023.03.0264

• 5-羟甲基胞嘧啶
• 乙型肝炎
• 肝癌
• DNA测序

目的 分析调控慢性乙型肝炎和乙肝相关肝癌患者血清样本中脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid, DNA)羟甲基化相关的关键基因和信号通路，探讨慢性乙肝进展为肝癌的可能机制。方法 选取2020年3月～2021年11月永康市第一人民医院乙肝肝癌患者和慢性乙型肝炎患者各40例，循环核酸(circulating free DNA,cfDNA)试剂盒法提取cfDNA,采用DNA羟甲基化测序技术检测两组样本的表达谱并筛选差异修饰基因(differentially modified genes, DMGs),运用生物信息学分析方法对DMGs进行生物学功能与通路富集分析。结果 检测到上调的DMGs数为28个，下调的DMGs数为3个；富集分析发现这些基因参与的主要生物学进程为单生物体过程类别、细胞类别、结合分子功能类别，主要的信号通路为代谢通路等。基于蛋白质互作网络(protein-protein interaction network, PPI)分析显示，在PPI中具有重要作用的基因为CSF2、ALB等。结论 肝癌发生发展过程涉及到多个基因和通路，这些具有5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine, 5hmC)修饰差异的基因和通路或将成为预防慢性乙型肝炎转化为肝癌的潜在靶点。

• 单位
  永康市第一人民医院