2014—2015年我国部分省份猪流行性腹泻病毒S基因的遗传变异分析

作者：王飞; 陈小芬; 苏丹萍; 宋亚兵; 焦臣鹏; 陈瑞爱; 贺东生

来源：中国兽医学报, 2016, 36(09): 1484-1488.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2016.09.03

• 猪流行性腹泻
• S基因
• 遗传变异

2010年以来,猪流行性腹泻肆虐我国的养猪业,给养猪业造成了严重的经济损失。为分析PEDV在我国最新的遗传变异情况,本试验对2014—2015年在7个省份分离的9株PEDV毒株的S基因进行克隆和测序,并将其分别与疫苗株、中国2010年前经典毒株、中国2010—2013年出现的毒株及韩国、美国近年来毒株进行S基因序列比对、分析。结果发现:9株PEDV S基因核苷酸同源性为98.4%99.5%;与疫苗株和中国2010年前经典毒株相比核苷酸同源性为93.4%96.2%;与中国、韩国、美国近年来暴发的毒株相比核苷酸同源性为97.4%99.2%。遗传进化树显示:我国常用的疫苗毒株CV777处于G1组,这9株毒株S基因均位于G2组,说明我国当前流行毒株与疫苗株和早期经典毒株的亲缘性相去较远。序列比对表明现阶段PEDV S基因已发生较大变异,存在高度相似的缺失,插入和变异,且在中和表位区域存在多处变异,可能降低常规疫苗的免疫保护作用。

• 单位
  华南农业大学; 广东温氏大华农生物科技有限公司