分子生态网络分析研究进展

作者：沈烽; 黄睿; 曾巾; 余钟波; 吴庆龙; 赵大勇

来源：环境科学与技术, 2016, S1: 94-98+173.

• 分子生态网络
• 网络分析
• 高通量测序
• 基因芯片 molecular ecological networks
• network analysis
• high-throughput sequencing
• microarray

目前由于宏基因组技术的高速发展,如高通量测序、基因芯片等,数据量得到了空前的增长。这使得研究不同物种、功能基因的相互作用网络成为可能。近年来网络分析被广泛的应用于生态学的研究。由于目前网络的构建方法各不相同,该文首先比较了各种方法,综合阐述了各种方法之间的利弊。然后从图论以及结合生态学的角度介绍了常用网络参数的含义,讨论了随机网络在研究生态网络中的作用。介绍了能更加深入地研究物种在网络中功能的方法:网络模块及节点类型的划分。最后简单介绍了环境物种网络。总的来说网络分析作为一种新颖的分析手段将更好的解释物种群落的组成。

• 单位
  湖泊与环境国家重点实验室; 河海大学; 水文水资源与水利工程科学国家重点实验室; 中国科学院南京地理与湖泊研究所