葡萄白藜芦醇合酶基因的克隆与生物信息学分析

作者：翟逸; 刘钦松; 吴永坤; 马云; 张念强; 石党委; 祁庆生

来源：食品工业科技, 2017, 38(19): 96-99.

DOI：10.13386/j.issn1002-0306.2017.19.018

• 葡萄
• 白藜芦醇合酶
• 基因克隆
• 序列分析

以葡萄总RNA为模板,利用RT-PCR的方法从葡萄中扩增获得一条白藜芦醇合酶基因完整的c DNA序列,命名为RS。利用生物信息学软件对其核酸和蛋白质序列进行分析,结果表明,该序列长1179 bp,与已报道的葡萄白藜芦醇合酶基因的序列相似性达到94%~99%,氨基酸序列相似性为96%~99%;RS基因编码392个氨基酸,氨基酸序列含有完整的芪合酶家族的特征序列GVLFGPGLT和活性中心序列GCYAGGTVLR;预测的分子量为42.78 k Da,理论等电点为6.57,不稳定参数为35.92,在分类上属于稳定性蛋白;二级结构主要以α-螺旋、无规则卷曲以及β-折叠为主,其中α-螺旋含量为44.13%、无规则卷曲含量为26.53%,β-折叠含量为17.66%。

• 单位
  微生物技术国家重点实验室; 生命科学学院; 山东大学