我国诺如病毒GII.6[P7]重组株基因组进化分析

作者：韦杏燕; 朱曦; 章青; 孔翔羽; 王萌璇; 杨艳辉; 靳淼^*; 段招军

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2022, 36(05): 501-507.

• 诺如病毒
• 急性胃肠炎
• 暴发
• 基因型
• 进化

目的明确我国诺如病毒暴发GII.6[P7]基因组进化特征和关键位点变异情况。方法对2018—2021年来自中国诺如病毒暴发监测网络(CaliciNet China)监测获得的46个GII.6[P7]阳性样本进行基因组扩增和测序, 同时整合GenBank数据库中的所有ORF1(GII.P7)和ORF2(GII.6)序列, 进行贝叶斯进化分析, 并利用Simplot软件进行重组分析。结果根据贝叶斯进化分析, GII.P7聚合酶具有时间进化特性, 平均碱基替换速率为2.067×10-3核苷酸替换/位点/年, 与4种不同的VP1基因型发生重组(GII.6、GII.7、GII.14和GII.20)。GII.6型诺如病毒在衣壳区进一步分为GII.6a、GII.6b和GII.6c亚型。本研究46个毒株属于GII.6a亚型, 与2015年中国GII.6[P7]参考株NHBGR59为一簇。Simplot分析确定本研究GII.6[P7]毒株重组位点在ORF1-2连接处。VP1氨基酸位点变异主要发生在P1.1末端以及P2区域, 与GII.6a亚型参考株相比, 受体结合位点均未发生变异。结论我国2018—2021年诺如病毒暴发的GII.6[P7]重组株均属于GII.6a[P7]亚型。

• 单位
  中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所