2014—2016年烟台市环境污水中A组轮状病毒的型别和分子特征

作者：**怡; 周楠; 林小娟; 王素婷; 纪峰; 徐爱强; 宋艳艳^*; 陶泽新^*

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2019, 33(05).

• A组轮状病毒
• 急性胃肠炎
• 分子流行病学
• 环境监测

目的了解环境污水中A组轮状病毒(group A rotavirus, RVA)基因型分布和分子流行病学特征, 探索环境污水监测在研究RVA区域性流行中的作用。方法 2014年1月至2016年12月期间, 在山东省烟台市每月采集生活污水标本, 浓缩处理后提取RNA, 进行逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增RVA VP7和VP4基因片段, 经纯化、TA克隆和Sanger测序后, 根据获得的序列进行基因定型和系统发生学分析。结果监测时间内共采集36份污水标本, 31份水样(检出率86.1%)RVA检出VP7和VP4阳性。共获得205条G基因型序列和239条P基因型序列, 分别属于4个G基因型和6个P基因型, 其中G9 95.6%(196/205)、P[8]58.6%(140/239)和P[4]28.0%(67/239)检出数量最多。对G9、P[8]和P[4]进行的系统发生学分析表明, 3种型别在当地均有多个传播链的共循环。结论本研究描述了烟台市环境污水中RVA的基因型分布和序列特征, 表明环境污水监测是探索一个地区RVA分子流行病学特征的有效途径。

• 单位
  山东省职业卫生与职业病防治研究院; 山东大学; 山东省疾病预防控制中心; 公共卫生学院