基于焦磷酸测序研究雪豹肠道微生物多样性

作者：刘咪; 朱静; 陈佳欣; 丁慧霞; 高迎; 姜文君; 袁坤; 董欣; 陈磊^*

来源：野生动物学报, 2019, 40(04): 873-881.

DOI：10.19711/j.cnki.issn2310-1490.2019.04.008

• 肠道微生物
• 雪豹
• 16S rRNA基因
• 焦磷酸测序

通过采集健康成年雪豹的新鲜粪便样品,借助高通量焦磷酸测序技术对雪豹肠道微生物多样性进行研究,并进行个体间差异的比较,为雪豹的救护饲养和营养生态学研究提供资料。研究结果表明,雪豹粪便微生物共包括9个细菌门,18个纲,31个目,64个科,82个属。其中丰度最高的5个细菌门分别是厚壁菌门(Firmicutes)(26. 58%—46. 59%),放线菌门(Actinobacteria)(29. 21%—46. 59%),拟杆菌门(Bacteroidetes)(1. 61%—16. 26%),梭杆菌门(Fusobacteria)(2. 03%—24. 78%)和变形菌门(Proteobacteria)(3. 10%—5. 79%)。放线菌门的红蝽菌科(Coriobacteriaceae)是雪豹粪便微生物中丰度最高的科。除样品5之外,红蝽菌科(Coriobacteriaceae)的丰度在其他样品中均占OTU总数的40%以上。柯林斯氏菌属(Collinsella)是雪豹粪便微生物中丰度最高的属。多样性分析表明雪豹肠道微生物群落具有较大的个体差异。

• 单位
  曲阜师范大学; 生命科学学院