前列腺癌恩杂鲁胺耐药基因的生物信息分析

作者:杨小兵; 魏德超; 冯涛; 赵佳晖; 王永兴; 韩毅力; 罗勇; 姜永光*
来源:现代泌尿外科杂志, 2022, 27(10): 872-877.
DOI:10.3969/j.issn.1009-8291.2022.10.016

摘要

目的 利用生物信息分析的方法筛选恩杂鲁胺(ENZ)耐药细胞株的潜在耐药基因。方法 从GEO数据库中下载ENZ耐药的前列腺癌(PCa)细胞株的数据集(GSE104935),利用生物信息分析的方法筛选差异表达基因,进行GO/KEGG富集分析,构建蛋白质互作(PPI)网络筛选潜在耐药的中枢(Hub)基因。结果 C4-2B耐药株与LNCaP耐药株共表达的上调基因为106个,下调基因为88个。GO/KEGG富集分析表明共表达基因在前列腺上皮组织生发、转录翻译的调节、泛素化蛋白的降解、化学致癌相关受体激活、癌症的表达失调及前列腺癌相关的生物过程及通路中富集。PPI网络分析得到在共表达的194个基因中起核心作用的前10Hub基因(上调:ACPP、AR和LEF1,下调:KLK2、TMPRSS2、ZBTB16、FOXO1、NKX3-1、PMEPA1和SLC45A3)。生存分析表明Hub基因中AR、FOXO1、NKX3-1和SLC45A3与PCa患者生存预后密切相关。结论 AR、FOXO1、NKX3-1和SLC45A3四个Hub基因,尤其是FOXO1和NKX3-1与去势抵抗型前列腺癌(CRPC)的恶性进展密切相关,可能成为改善ENZ疗效、延长CRPC患者生存时间的潜在治疗靶点。

  • 单位
    首都医科大学附属北京安贞医院

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