三角褐指藻DGAT1基因生物信息学分析及表达调控研究

作者：王何瑜; 龚一富^*; 郑小恽; 李申睿

来源：宁波大学学报(理工版), 2021, 34(04): 1-7.

• 三角褐指藻
• DGAT1基因
• 克隆
• 生物信息学
• 基因表达调控

本研究采用转录组测序获得了三角褐指藻DGAT1基因cDNA全长序列(GeneBank登录号:7200924),并对其进行生物信息学分析和表达调控研究.结果表明,三角褐指藻DGAT1基因cDNA序列全长为1 438 bp,开放阅读框(ORF)为1 098 bp,编码365氨基酸序列,含有脂肪酸蛋白特性(Ⅰ)和DAG结合位点(Ⅱ)等功能结构域.预测三角褐指藻DGAT1蛋白为亲水性蛋白,含有6个跨膜结构域和7个超强跨膜螺旋区,无信号肽.进化树分析表明,三角褐指藻与海链藻DGAT1蛋白同源性最高. RT-qPCR结果表明,光照强度和温度均显著促进三角褐指藻DGAT1基因的表达.随着光照强度和温度的增加,三角褐指藻DGAT1基因的表达量呈先升高后降低趋势,在光照强度为2 500 lx或温度为25℃时,三角褐指藻DGAT1基因的表达量达到最大,这与三角褐指藻总脂含量的变化趋势一致,同样揭示DGAT1蛋白与三角褐指藻总脂生物合成与积累密切相关.

• 单位
  宁波大学