版纳微型猪近交系PSP-I基因的克隆及生物信息学分析

作者:查星琴; 成文敏; 潘伟荣; 李海昌; 张莹; 霍金龙; 黄英*
来源:中国畜牧杂志, 2020, 56(11): 91-94.
DOI:10.19556/j.0258-7033.20200102-06

摘要

本研究旨在克隆版纳微型猪近交系(BMI)PSP-I基因并对其进行生物信息学分析。通过RT-PCR方法从15月龄BMI睾丸组织中克隆PSP-I基因,利用生物信息学方法分析其序列组成特征。结果表明:克隆的PSP-I基因mRNA序列长420 bp,其中CDS长241 bp,编码79个氨基酸,推测编码蛋白分子量为8.588 9 ku,理论等电点为8.64,酸性氨基酸(Asp+Glu)有8个,碱性氨基酸(Lys+Arg)有10个;PSP-I蛋白质属于稳定蛋白,为疏水蛋白,无跨膜信号肽位点,存在1个N-糖基化位点和8个潜在磷酸化位点;无规则卷曲是PSP-I蛋白的主要结构。

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