摘要
目的 探索脓毒症患者发生急性肺损伤的发病机制和生物标记物。方法 利用R语言在GEO数据库中筛选脓毒症和脓毒症合并急性肺损伤患者两组转录组数据集的差异基因,利用String数据库构建差异基因蛋白-蛋白相互作用网络,利用Cytoscape软件鉴定枢纽基因,利用R语言分析枢纽基因在两组数据集mRNA的相对表达和表达相关性;利用miRTarBase数据库和NetworkAnalys网站构建miRNA-gene网络,筛选与枢纽基因作用的miRNA,利用CIBERSORTx网站对两组数据集进行免疫细胞浸润评估,利用CTD数据库搜索与脓毒症合并急性肺损伤相关的生物标记物作用的分子化合物,以预测脓毒症合并急性肺损伤的治疗药物。结果 共鉴定出差异基因12个,其中3个表达上调,9个表达下调;脓毒症患者发生急性肺损伤机制与细胞周期缩短、细胞凋亡增加、细胞铁死亡增加相关;枢纽miRNA miR-335-5p和枢纽基因CDKN1A可能是脓毒症合并急性肺损伤与发病机制相关的重要生物标记物和靶向治疗标记物,共有687种分子化合物与CDKN1A作用,发挥上调其表达的作用。结论 miR-335-5p和CDKN1A可能是脓毒症合并急性肺损伤潜在的与发病机制相关的重要生物标记物。
-
单位大坪医院; 中国人民解放军陆军军医大学; 中心实验室