只有适应性免疫才能建立免疫记忆的观点曾经被普遍接受,但最近,这一观点受到了挑战。在缺乏适应性免疫的生物体以及某些哺乳动物体内,先天性免疫系统可以起到抵抗再感染的作用,这种现象称为训练后免疫或先天性免疫记忆。先天性免疫记忆是通过表观遗传重编程来实现的,通常表现为基因表达以及细胞生理学的持续改变,与适应性免疫不同的是,该过程不涉及永久性遗传改变。
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