白纹伊蚊微卫星标记的筛选及种群遗传研究

作者：魏勇; 胡珂; 陈钰蓝; 王佳甜; 郑学礼^*

来源：现代预防医学, 2020, 47(07): 1267-1290.

• 白纹伊蚊
• 微卫星标记
• PCR
• 生物信息学
• 种群遗传

目的筛选出有效的白纹伊蚊微卫星标记(SSR),并利用这些SSR分析六个不同地区白纹伊蚊种群遗传特征。方法通过文献查找已公布于数据库的白纹伊蚊SSR位点,利用聚合酶链式反应(PCR)和生物信息学的方法选定白纹伊蚊SSR,ABI3730测序白纹伊蚊基因组中的这些SSR位点,通过STRUCTURE聚类分析和系统进化树分析六个不同地区种群遗传结构。结果查阅文献共找到49个已公布于数据库的白纹伊蚊SSR位点,选取最近发表的29个SSR做PCR鉴定,选取了其中16个多态性高且均匀分布在染色体上的SSR位点,利用这16个SSR位点对6个不同白纹伊蚊种群进行种群遗传分析。分析结果显示地理距离相近的种群遗传距离较近,并确定了最优类群数为2,可将这6个种群分为两个类群,南北方的白纹伊蚊种群分别聚为一个类群。结论通过PCR和生物信息学的方法筛选出的白纹伊蚊SSR位点,能够应用于白纹伊蚊种群遗传研究,并将本研究的6个不同白纹伊蚊种群成功地划分为南北两个类群。

• 单位
  南方医科大学; 公共卫生学院