溶藻弧菌质粒pVAE259全序列测定与分子生物学特征分析

作者：苏婷; 罗鹏; 任春华; 胡超群

来源：微生物学报, 2010, (02): 162-168.

DOI：10.13343/j.cnki.wsxb.2010.02.017

• 溶藻弧菌
• 质粒
• 复制区域
• 开放性阅读框 Vibrio alginolyticus
• plasmid
• replication region
• open reading frames

【目的】获得溶藻弧菌环状质粒pVAE259全序列,分析其分子生物学特征并探索该质粒可能具备的功能。【方法】使用酶切、克隆测序的方法获得pVAE259的全序列,利用软件分析DNA序列和可能的编码蛋白,推测质粒的生物学信息。【结果】pVAE259为闭合环状质粒,全长6,075 bp,GC含量为42.16%。在NCBI中比对发现pVAE259与Vibriosp.41隐蔽性质粒pPS41具有较高的相似性。我们在序列中找到一个oriT位点,另外全序列的4118-5494 bp推测为质粒复制区域。pVAE259中存在7个氨基酸序列长度大于100的开放式阅读框(ORF):ORF1-ORF7。其中ORF1编码...

• 单位
  中国科学院; 中国科学院南海海洋研究所