睾丸酮丛毛单胞菌QYY降解喹啉的转录组分析

作者:许馨; 赵雪莹; 霍洪亮; 于杨; 彭举威; 霍明昕*
来源:东北师大学报(自然科学版), 2020, 52(04): 123-130.
DOI:10.16163/j.cnki.22-1123/n.2020.04.019

摘要

以分离出的一株喹啉降解菌睾丸酮丛毛单胞菌QYY为实验对象,利用转录组测序技术,对喹啉质量浓度为0(C组)、100 mg/L降解6h(Q-100组)及400 mg/L降解7h(Q-400组)条件下的菌株进行了测序分析,研究了睾丸酮丛毛单胞菌对喹啉的降解途径和相关基因.结果表明:与对照C组相比,Q-100和Q-400组中分别有上调基因606和915个、下调基因510和685个.其中,参与喹啉降解的bphB基因在两组实验组中均显著上调,ligABC基因在Q-100组中显著上调.此外差异基因主要富集在KEGG数据库中ABC转运系统与能量代谢中,这与底物的识别转运、信号转导、基因表达调控及能量提供有关.

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