2018～2019年我国部分地区新城疫病毒的F基因序列分析

作者：胡秀美; 仇微红; 梁昭平; 钟文婷; 叶贺佳; 罗开健

来源：养禽与禽病防治, 2021, (01): 2-7.

• 新城疫病毒
• F基因
• 遗传进化分析
• 基因相似性

本研究自2018～2019年从疑似感染新城疫的家禽病料分离鉴定出13株新城疫病毒(Newcastle disease viruses, NDV),采用RT-PCR方法对这13株NDV分离株的F基因进行扩增,产物经TA克隆并测序后与GenBank数据库中的参考毒株进行遗传进化分析。结果显示,其中的7株属于基因II型,5株属于基因VI型,1株属于ClassⅠ亚型。F基因相似性分析结果显示,7株基因Ⅱ型毒株与疫苗株La Sota、B1、Clone 30的核苷酸相似性在98.1%～100%之间,氨基酸的相似性在97.6%～100%之间。5株基因VI型分离株与II、VII型疫苗株及VIb亚型代表株之间的核苷酸相似性在79.7%～98.4%之间,氨基酸的相似性在76.6%～97.6%之间。1株基因Ⅰ型的分离株与II、VII型疫苗株及ClassⅠ代表毒株的核苷酸相似性在52.1%～97.3%之间,氨基酸的相似性在68.5%～96.8%之间,表明当前部分地区的NDV分离株与传统疫苗株之间存在较明显的遗传特征差异。

• 单位
  广州市华南农大生物药品有限公司; 华南农业大学