本发明公开了一种高稳定性纳米纤维素基中性笔墨水及其制备方法。该方法包括以下步骤:(1)纳米纤维素悬浮液与非离子型或弱离子型色素复合;(2)在步骤(1)得到的溶液中加入表面活性剂降低表面张力,得到高稳定性纳米纤维素基中性笔墨水。本发明制备的高稳定性纳米纤维素基中性笔墨水,摆脱了传统的中性笔墨水组成体系,制备过程不会产生对人体造成损伤的可挥发性有机化合物。而且制备过程简单,原料、制备及使用过程绿色环保,颜色深度及流变性参数调整简便有效,墨水稳定性高。