胞外酸中毒对未成熟树突状细胞蛋白质组学的影响

作者：邱炜; 童璐; 张世超; 杨颖颖; 黄瑾; 曾柱; 岳萍

来源：基因组学与应用生物学, 2022, 41(05): 1091-1102.

DOI：10.13417/j.gab.041.001091

• 胞外酸中毒
• 未成熟树突状细胞
• 蛋白质组
• 差异表达蛋白

研究胞外酸中毒对未成熟树突状细胞(immature dendritic cells, imDCs)蛋白质组表达水平的影响，能够为深入研究酸性病理微环境调控imDCs免疫功能的分子机制奠定前期基础。体外诱导小鼠骨髓细胞分化为imDCs, pH6.5酸性条件处理imDCs 24 h,然后使用Label-free定量技术筛选出差异表达蛋白，结果显示，pH6.5处理使imDCs的389个蛋白表达发生显著变化。GO分析差异表达蛋白参与的细胞组分、分子功能及生物过程，KEGG分析差异表达蛋白涉及的信号通路，结果显示，这些差异表达蛋白参与核糖体形成、影响离子跨膜转运、细胞呼吸调节等过程，涉及的信号通路包括亨廷顿病信号通路、核苷酸结合寡聚化结构域(nucleotide-binding oligomerization domain, NOD)样受体信号通路以及环腺苷一磷酸(cyclic adenosine monophosphatec, cAMP)信号通路等。利用Cytoscape软件展示差异表达蛋白之间的互作网络图，并按照节点数筛选关键蛋白，筛选出下调关键差异表达蛋白核糖体蛋白(ribosomal protein, RP) S27A、核糖体蛋白S23(RPS23)、核糖体蛋白L21(RPL21)和CREB结合蛋白(CREB-binding protein, CREBBP)以及上调关键差异表达蛋白淀粉样前体蛋白(amyloid precursor protein, APP)和可溶性N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白受体同源蛋白(soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptors homolog, YKT6)等。

• 单位
  贵州医科大学; 基础医学院