河北省鼠疫菌CRISPR基因分型及流行病学分析

作者：周松; 杜国义; 李伟; 刘晓伟; 刘广; 王海峰; 王宇萌; 田亚汀; 陈永明; 刘合智; 史献明^*

来源：中华卫生杀虫药械, 2020, 26(04): 361-363.

DOI：10.19821/j.1671-2781.2020.04.019

• 鼠疫菌
• 基因分型
• 规律聚集簇间隔短回文重复序列

目的对河北省鼠疫菌株进行规律聚集间隔短回文重复序列CRISPR)基因分型。方法利用聚合酶链式反应(PCR),采用3对CRISPR引物,对河北省分离的128株鼠疫菌进行扩增,测定扩增产物核酸序列并进行分析,确定河北省菌株CRISPR基因型。结果 128株鼠疫菌在3个CRISPR位点上有8种间隔序列,包括al、a2、a3、b1、b2、c1、c2、c3,分为2个基因型。118株鼠疫菌株为Cb2型,另外10株鼠疫菌均为新基因型(命名为Cc△1型)。结论通过CRISPR分析显示河北省鼠疫菌株遗传进化比较稳定,建立了CRISPR基因库,为鼠疫菌种群遗传进化和鼠疫防控的研究提供参考。

• 单位
  中国疾病预防控制中心; 河北北方学院; 河北省鼠疫防治所