SXT/R391元件核心基因的生物信息学分析

作者：张琪; 周静; 周江林; 孔娜; 胡明达; 彭小川; 李北平; 梁龙; 靳远^*; 任洪广^*; 岳俊杰^*

来源：生物技术通讯, 2019, 30(05): 597-603.

• SXT/R391元件
• 重组分析
• 正选择分析

目的:SXT/R391元件是革兰阴性菌中研究最充分、已知成员最多的整合性接合元件家族,本研究的主要目的是探讨SXT/R391元件核心基因组的适应性进化规律。方法:收集数据库中及文献报道的SXT/R391家族元件数据,并利用已测序的细菌基因组序列预测该家族元件,分析元件核心基因的进化特性。结果:通过文献搜集和预测,共获得83个SXT/R391元件的基因组序列。在52个核心基因中,计算发现22个基因在进化过程中经历了重组,基因分布于SXT/R391元件的4个必需模块。此外,在7个基因中检测到了正选择信号。结论:分析了SXT/R391元件核心基因的进化机制,为了解该家族的进化和扩散奠定了基础。