微卫星标记分析水稻地方品种30年的遗传变异

作者：严红梅; 董超; 张恩来; 汤翠凤; 阿新祥; 杨文毅; 杨雅云; 张斐斐; 徐福荣

来源：遗传, 2012, 34(01): 89-96.

• 元阳哈尼梯田
• SSR标记
• 遗传多样性
• 等位基因位点
• 水稻

为揭示水稻(Oryza sativa)地方品种30年的遗传变异状况,文章通过60个SSR标记,对元阳哈尼梯田农户在20世纪70年代种植的6个(简称"过去的品种")和近10年间种植的对应6个(简称"当前的品种")代表性水稻地方品种进行检测。结果表明,共检测到159个等位基因(Na),等位基因数1～4不等,当前的品种较过去的品种减少7个等位基因。平均每个标记检测到的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、基因型多样性(H′)和位点多态信息含量(PIC)4个指标均为过去的品种高于当前的品种,分别是(Na)为2.567>2.450,(Ne)为2.052>1.968,(H′)为0.768>0.722,(PIC)为0.469>0.439。基于60个SSR标记,过去6个品种间的遗传相似性系数(GS)平均值为0.437,变幅为0.117～0.667,而当前6个品种间平均值为0.473,变幅为0.200～0.700。总的说来,水稻地方品种经过30年自然和人工选择,遗传多样性降低,不同品种存在等位基因大小的差异程度不同。

• 单位
  云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所; 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所; 农业部