肝细胞癌中铜死亡标志物的筛选及化合物的预测

作者:张楠楠; 付朝举; 张学武; 李军*
来源:河南大学学报(自然科学版), 2023, 53(06): 706-717.
DOI:10.15991/j.cnki.411100.2023.06.006

摘要

通过文献查阅铜死亡相关基因,使用STRING数据库对铜死亡相关基因产物进行PPI分析;使用R语言、Kaplan-Meier方法、THPA以及TIMER等数据库进行铜死亡相关基因与HCC相关的差异表达分析、ROC分析、临床的相关性分析、免疫浸润,最后将得到的铜死亡相关基因进行药物筛选和分子对接.结果显示,共筛选出4个与肝癌相关性较强的铜死亡相关基因,即DLAT、CDKN2A、GLS和MTF1,它们主要参与TCA循环、铂类耐药性、癌症中的碳代谢、丙酮酸代谢、糖酵解/糖异生等.4个基因与患者5年生存率相关性较大,与性别、淋巴结转移、肿瘤分期和免疫细胞密切相关,最后筛选出阿霉素、表没食子素没食子酸酯、曲格列酮、熊去氧胆酸等与上述蛋白结合能力较高的活性化合物.

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