储存红细胞中表达降低的circRNA以及其靶基因预测的研究

作者：张怡宇; 黄国清; 王强; 张勇刚; 苑召虎; 陈小洁; 黄建云; 李楠; 魏亚明^*

来源：临床输血与检验, 2021, 23(04): 428-434.

DOI：10.3969/j.issn.1671-2587.2021.04.005

• 红细胞储存损伤
• 环状RNA分子
• 小分子RNA
• 凋亡
• CASP8

目的探讨储存红细胞中表达降低的circRNA靶基因预测及其与储存损伤的关系。方法 3(人)份血样来自健康无偿献血者血液制备的悬浮红细胞,滤除白细胞后均分为新鲜组(0 d),4 ℃储存20 d红细胞组(储存组);对2组标本用高通量测序检测,选取下降明显的10个circRNA做PCR验证,用circBase和mirTarBase完成数据库注释与靶向预测,并将miRNA可能作用的mRNA也进行了关联分析,以此筛选到可能与储存损伤密切相关的circRNA。结果 20 d与0 d组对比,hsacirc0005413、hsacirc0008937、hsacirc0040340、hsacirc0003126、hsacirc0007995、hsacirc0023937、novelcirc0000402、hsacirc0028281表达量显著下降(P<0.05);hsa-miR-7160-5p、hsa-miR-122-5p、hsa-miR-4534的表达量显著上升(P<0.05);CASP8、CDK4、TMOD3显著下降(P<0.05)。生物信息学分析显示这些circRNA的靶基因参与红细胞凋亡与抗凋亡、红细胞膜的稳定、红细胞氧化损伤、铁代谢等生理过程。结论本研究构建了几个差异表达的circRNA-miRNA-mRNA网络,发现hsacirc0005413-hsa-miR-7160-5p-CASP8、hsacirc0040340-hsa-miR-122-5p-CDK4、hsacirc0007995-hsa-miR-4534-TMOD3可能参与了红细胞储存损伤的生物学过程。

• 单位
  广州市第一人民医院; 深圳市龙华区中心医院