中江县丹参连作土壤细菌多样性研究

作者:陈章; 王强锋; 陈强*; 刘轶豪; 张凌子
来源:西南农业学报, 2019, 32(12): 2890-2895.
DOI:10.16213/j.cnki.scjas.2019.12.028

摘要

【目的】为了揭示中江县丹参连作土壤的细菌多样性。【方法】在中江丹参GMP基地采取患病丹参根际与非根际土壤、正常生长丹参根际与非根际土壤,采用可培养和免培养技术细菌研究供试土壤的细菌类群变化。【结果】应用稀释分离法,从供试土壤中获得46株可培养细菌,16S rDNA-RFLP分析表明,在79%相似水平分为7个遗传群,对代表菌株16S rDNA进行序列分析,构建了系统发育树,供试菌株为芽孢杆菌属(Bacillus)、短杆菌属(Brevibacterium)、拜叶林克氏菌属(Beijerinckia)和假单胞菌属(Pseudomonas)。【结论】PCR-DGGE图谱聚类分析表明,丹参连作显著影响了土壤细菌类群,供试土壤细菌类群间存在着明显的遗传多样性;条带克隆测序表明绝大多数菌株属于未培养细菌。

  • 单位
    四川省农业科学院农业信息与农村经济研究所; 四川省农业科学院生物技术核技术研究所; 四川农业大学