摘要
目的本研究旨在通过对2020年西藏自治区5岁以下健康儿童中携带埃可病毒11型(echovirus11, E11)的基因特征进行研究, 掌握肠道病毒的流行情况, 填补西藏自治区关于E11基因特征研究的空白。方法收集2020年在中国西藏自治区内采集的0~5岁健康儿童的粪便标本, 通过病毒分离和肠道病毒分子定型方法, 对阳性病毒分离物进行肠道病毒血清型鉴定, 并对鉴定结果为E11的病毒分离物进行全长VP1区扩增及核苷酸序列测定和分析。使用MEGA软件构建基因进化树(最大似然法), 与中国其他省份E11和全球E11进行遗传进化分析。结果 574份粪便标本中分离到89株肠道病毒分离株, 其中E11有44株, 是主要的血清型, VP1区核苷酸序列之间的相似性为96.4%~100%, 在系统发育树上呈现为多个传播链, 但均属于D5基因亚型, 且与我国2017年后其它省份E11流行株聚为一簇。结论本研究获得了我国西藏自治区流行的E11的基因特征的基本信息, 并了解了全球E11的基因型分布。
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单位西藏自治区疾病预防控制中心; 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所