广西那坡县发现乙肝病毒新基因亚型D11

作者：任创创; 陈钦艳; 王学燕; 杨庆利; 胡莉萍; 刘华兵; 何翔; 贾蕙华; 方钟燎^*

来源：应用预防医学, 2019, 25(02): 88-98.

DOI：10.3969/j.issn.1673-758X.2019.02.002

• 乙型肝炎病毒
• 系统进化分析
• 亚型D11

目的 2011年,在广西那坡县发现一例HBsAg阳性携带者,其所携带的HBV利用S基因序列分型法无法分型,本研究意在用全基因组分型法对其进行分型。方法为便于前后对比,除2011年血清标本外,还收集该携带者2018年的血清标本。检测前后2份标本HBV血清标志物和病毒载量,使用酚氯仿法提取HBV DNA,巢式PCR扩增HBV全基因组,将扩增产物进行克隆并测序。利用软件Mega 6.0、 Bioedit 7.0对测序结果进行分析。结果 2011年和2018年的2份标本HBsAg均为阳性, 2份标本的PCR产物分别获得15个克隆株。对获得的克隆株进行生物信息学分析发现, 2011年该携带者体内乙肝病毒基因型为B型、 D型以及未知基因型; 2018年该携带者体内乙肝病毒基因型仅为D型。30个克隆株中有23个单独聚集成簇, bootstrap值为100%,与D1-D10亚型间核苷酸的差异>4%。结论该携带者体内的HBV基因型为新基因亚型D11。

• 单位
  广西医科大学; 基础医学院; 广东省疾病预防控制中心; 广西壮族自治区疾病预防控制中心