Liverbase:人类肝脏蛋白质组数据库应用系统的研发

作者：王雪; 刘齐军; 朱云平

来源：军事医学科学院院刊, 2010, (03): 201-205.

• 肝脏
• 数据库
• 蛋白质组
• 转录组
• 蛋白质注释 liver
• database
• proteome
• transcriptome
• protein annotation

目的人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)的顺利实施产出了大量的肝脏蛋白质组数据,这也是迄今最大的人类组织器官的蛋白质组数据。为帮助科学家方便有效地利用这些数据,我们开发了人类肝脏蛋白质组数据库Liverbase。方法 Liverbase基于MySQL、JSP、JavaBean和JDBC等技术而开发。主要针对数据库系统结构、数据处理及注释、数据库系统功能及使用三方面展开并进行详细的阐述。结果 Liverbase的主要功能是展示、管理和检索人类肝脏蛋白质组计划鉴定到的蛋白质及其功能注释信息。对每个鉴定到的蛋白质提供了全面的注释信息,整合了mRNA/蛋白质丰度信息。结论 Liverbase具有简捷实用、...

• 单位
  北京蛋白质组研究中心; 国防科学技术大学; 蛋白质组学国家重点实验室; 军事医学科学院放射与辐射医学研究所