随着国家对高等教育越来越重视,投入的财政专项资金越来越多,管理问题越来越多,管理难度也逐渐提高。本文针对高校财政专项资金管理存在的问题,提出具有针对性的管理措施,包括建立科学合理的管理制度、提升项目预算编制的准确性和科学性、加强财政专项资金管理及提高预算执行水平、加强项目资金专款专用、完善高校绩效评价体系等,从而提高财政专项资金管理水平,促进高校教育事业快速发展。