猪源microRNAs靶向非洲猪瘟病毒基因区域分析

作者：赵志国; 魏立翔; 刘良波; 张辉; 肖非; 闫卫疆; 高宏伟; 孙雪梅; 雷银凤; 孙延鸣^*; 张彦兵^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2022, (17): 85-91.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2021.09.0283

• ASFV
• miRNAs
• 基因序列
• 抗病毒
• 保守性
• miRanda

为了探讨宿主microRNAs (miRNAs)是否靶向非洲猪瘟病毒(ASFV)基因，以及初步确定miRNAs靶向病毒基因的区域，试验以ASFV感染猪差异表达的miRNAs为研究对象，利用miRanda软件分析miRNAs靶向ASFV基因的具体区域和结合能力，再利用MEGA 7.0软件分析miRNAs所靶向的ASFV基因序列的保守性。结果表明：ssc-miR-122和ssc-miR-125b可同时靶向ASFV CP2475L基因，其中ssc-miR-122靶向该基因4个区域；ssc-miR-181a和ssc-miR-125b可同时靶向ASFV MGF＿300-4L基因，其中ssc-miR-181a靶向该基因2个区域；此外，ssc-miR-181a可靶向ASFV NP1450L、E111R基因，ssc-miR-125b靶向ASFV P1192R基因，ssc-miR-145-5p靶向ASFV NP868R、C717R、MGF＿505-1R等8个基因，ssc-miR-126-3p靶向ASFV G1211R、EP296R、MGF＿110-5L-6L基因，ssc-miR-92a靶向ASFVI329L和EP424R基因；选择多个miRNAs所靶向的ASFV CP2475L和MGF＿300-4L基因序列构建进化树，CP2475L和MGF＿300-4L基因序列同源性均为100%。说明猪源miRNAs具有潜在的靶向抑制ASFV复制的能力，初步明确了ssc-miR-122、ssc-miR-181a、ssc-miR-125b等miRNAs靶向ASFV CP2475L、MGF＿300-4L等基因的具体区域。

• 单位
  动物科技学院; 石河子大学