摘要
为了探究皱皮香猪皮肤褶皱表型形成的原因,试验采用转录组测序和生物信息学比对分析方法,以正常香猪为对照,对皱皮香猪皮肤中胶原蛋白编码基因的表达量和表达差异进行研究。结果表明:根据转录组测序数据,从皱皮香猪皮肤中共鉴定出30个胶原蛋白编码基因;表达量最高的3个基因分别为Ⅰ型胶原蛋白编码基因COL1A1和COL1A2及Ⅲ型胶原蛋白编码基因COL3A1,其在正常香猪皮肤中的平均每百万读数(CPM)值分别为20 881,10 498,22 006,在皱皮香猪皮肤中的平均CPM值分别为9 363,5 232,10 551,这3个基因的表达量呈下调趋势(P>0.05);而Ⅵ型胶原蛋白编码基因COL6A5、COL6A6和ⅩⅣ型胶原蛋白编码基因COL14A1表达量呈显著上调趋势(P<0.05)。说明皱皮香猪皮肤中胶原蛋白编码基因的表达量低于正常香猪,可能与皱皮香猪皮肤的胶原纤维含量不足、组织结构紊乱有关,胶原蛋白编码基因COL1A1、COL1A2和COL3A1的下调以及COL6A5、COL6A6和COL14A1的上调可能是导致皱皮香猪皮肤产生褶皱的原因之一。
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单位贵州大学; 动物科学学院