可变剪接在肺腺癌预后中的价值

作者：张世超; 欧阳燕; 兰应武; 唐福州; 胡祖权; 曾柱^*

来源：贵州医科大学学报, 2019, 44(11): 1254-1261.

DOI：10.19367/j.cnki.1000-2707.2019.11.003

• 肺肿瘤
• 预后
• 肺腺癌
• 可变剪接
• 临床结果
• 核心基因

目的:探讨可变剪接在肺腺癌预后中的作用。方法:在TCGA数据库中收集474例肺腺癌组织的RNA-seq数据,绘制可变剪接图谱;通过单因素Cox回归分析确定肺腺癌中存活相关的剪接事件,再利用最小绝对收缩模型筛选用于监测存活的预后因子;收集5例肺腺癌患者的癌组织,采用PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳检测CHEK1、KIF23、MCM7和FN1的mRNA亚型条带。结果:在肺腺癌中存在着大量的可变剪接事件并与预后相关,包括CHEK1、KIF23、MCM7和FN1,通过生物信息学利用可变剪接事件构建了高效的风险预测模型;KEGG途径分析表明,主要富集的基因与""regulation of autophagy"、"central carbon metabolism in cancer"和"cell cycle"有关;5例肺腺癌患者的癌组织PCR扩增结果显示,可变剪接核心基因CHEK1、KIF23、FN1确实存在CHEK1-AP-19309、KIF23-AP-31390、FN1-ES-57398等剪接体。结论:可变剪接事件可作为预测肺腺癌患者临床结果的指标,可为肺腺癌患者制定个体化治疗方案提供依据。

• 单位
  贵州医科大学; 基础医学院