全额拨款事业单位是一种非营利机构,在当今社会有着无可取代的地位,只有建立起科学、完善的内部控制体系,才能有效地保障国家财产的安全,具有促进廉政的能力建设,加强国家的宏观管理,确保内部高效运作。同时,对全面推进我国财政、政治、文化、社会三个方面的制度建设,对法治社会、廉洁政府的建设都具有十分重要的时代意义。当前,一些全额拨款事业单位在财政管理上的思路和方法已经不能适应市场经济的要求。为此,文章对全额拨款事业单位的内部控制问题进行了探讨,并针对这些问题提出了相应的优化建议。