采用改良TCA/丙酮法提取万寿菊外植体全蛋白,优化双向电泳各个技术环节,建立适合万寿菊全蛋白分析的双向电泳体系。结果表明:采用改良TCA/丙酮法提取全蛋白是TCA/丙酮法的8倍;使用17 cm,pH 4~7的IPG胶条,蛋白上样量为600μg,分离胶浓度为12%,考马斯亮蓝染色后可得到背景清晰,分辨率好的蛋白2-DE图谱。综上,优化后的蛋白质提取方法以及双向电泳技术体系适用于干旱条件下NO和H2O2促进万寿菊不定根发生过程中的全蛋白分析。