基于RNA-Seq技术分析不同产蛋量庄河大骨鸡垂体和下丘脑的可变剪接事件

作者：马智勇; 李美成; 马巍; 王春强^*

来源：中国农学通报, 2023, 39(32): 150-157.

• 鸡
• 可变剪接
• RNA-Seq
• 差异剪接基因
• 产蛋量

近年来，庄河大骨鸡个体产蛋数量出现较大差异。可变剪接(Alternative splicing,AS)是真核基因转录后调控的重要机制，但目前尚无关于AS与禽垂体和下丘脑产蛋量相关性的研究。本试验基于RNA-Seq技术对大骨鸡AS事件进行分析。结果表明：在垂体和下丘脑文库中分别检测到769和813个差异AS事件。2种文库（垂体、下丘脑）中均鉴定出5种类型的AS事件，其中外显子跳跃(SE)的比例最高，而替代5’剪接位点(A5SS)的比例最低；NRCAM,SLMAP和CIB1基因的AS发生频率较高；2种组织文库中分别筛选出644和680个差异剪接基因(DSGs)，其中SE的比例最高，A5SS的比例最低。GO和KEGG富集分析分别对329个和337个DSG进行功能注释；RT-PCR检测发现，ESR1存在于不同的AS事件中；12个文库中共获得6758个新的转录本，优化了12486个基因。研究结果不仅扩展了对家禽垂体和下丘脑组织中AS事件的认识，且为研究生产中提高鸡的产蛋量提供新的思路。

• 单位
  锦州医科大学