文冠果XsSCL6基因克隆及表达分析

作者：赵雅欣; 陈雨欣; 卢涵冰; 颜秉舟; 敖妍^*

来源：西北植物学报, 2023, 43(10): 1640-1652.

• 文冠果
• XsSCL6
• 基因克隆
• 生物信息学
• 表达分析

GRAS家族HAM亚家族(scarecrow-like 6,SCL6)是一类植物特有的转录因子，在植物生长发育中具有关键作用，文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge)是国特有的重要林木能源植物，雄花的雌蕊败育是造成产量低的主要原因，为解析XsSCL6基因在文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge)雌蕊发育中的调控作用，采用RT-PCR方法克隆文冠果4个XsSCL6同源基因，并对关键XsSCL6a蛋白进行亚细胞定位；对XsSCL6基因进行生物信息学分析，利用qRT-PCR分析XsSCL6基因在文冠果雌蕊败育过程中的表达模式。结果表明，(1)获得文冠果XsSCL6a、XsSCL6b、XsSCL6c和XsSCL6d基因ORF全长，分别编码751,669,717,717个氨基酸，均属于亲水不稳定蛋白。(2)文冠果XsSCL6蛋白主要由无规则卷曲和α-螺旋构成，定位于细胞核。(3)XsSCL6a、XsSCL6c和XsSCL6d均包含GRAS保守结构域，文冠果XsSCL6蛋白和克莱门柚及甜橙的亲缘关系最近。(4)文冠果XsSCL6基因启动子中包含多种激素响应元件、植物发育相关元件。(5)qRT-PCR结果显示，XsSCL6基因各个时期在雄花中的表达量显著高于雌花，表达量的趋势和转录组FPKM值一致。(6)xso-miR171和XsSCL6基因均存在裂解方式的靶向关系，TPM值和FPKM值为负相关关系。XsSCL6基因可能受到xso-miR171调控，共同参与文冠果雌蕊发育过程，对文冠果花发育具有重要作用。

• 单位
  省部共建森林培育与保护教育部重点实验室; 北京林业大学