长吻单核苷酸多态性标记与生长性状关联分析

作者：李哲; 李雨; 敬庭森; 刘小莉; 闫卉果; 陆安帅; 周剑; 罗辉; 叶华^*

来源：渔业科学进展, 2022, 43(04): 127-135.

DOI：10.19663/j.issn2095-9869.20210412001

• 长吻
• SNP
• 生长性状
• 关联分析

为开发长吻(Leiocassis longirostris)生长性状相关的分子标记，为其分子辅助育种提供基础资料，以115尾长吻为研究对象，运用57个单核苷酸多态性标记(SNPs)位点与体重、全长、体长和头高进行关联分析。结果显示，有10个SNPs位点与生长性状显著相关，其中3个SNPs位点(Cluster-65＿137265、Cluster-65＿111833和Cluster-65＿137642)对所测量的4个生长性状均有显著影响(P<0.05);3个SNPs位点(Cluster-65＿120392、Cluster-65＿5592＿0和Cluster-65＿105077)对体重、全长和体长有显著影响(P<0.05);Cluster-65＿110382对全长、体长和头高有显著影响(P<0.05);Cluster-65＿19497和Cluster-24304＿1对全长和体长有显著影响(P<0.05);Cluster-65＿130153对体长和头高有显著影响(P<0.05)。此外，Cluster-65＿137265、Cluster-65＿111833、Cluster-65＿110382和Cluster-65＿137642分别与阴离子交换蛋白2样亚型X1 (anion exchange protein 2-like isoform X1)神经突起导向因子4样(netrin-4-like)、酪氨酸蛋白激酶Tec亚型X2 (tyrosine-protein kinase Tec isoform X2)和氨甲酰磷酸合成酶1 (carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, CPS1)相似度最高，表明这4个基因可能参与调控了长吻的生长。对与生长相关的10个SNPs位点进行多态性检测，平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.537和0.467，平均多态信息含量为0.357。本研究为长吻的遗传改良和选择育种提供了基础资料，并首次发现了4个可能与长吻生长相关的基因。

• 单位
  西南大学