模拟失重下氧化应激对EA. hy926细胞影响的转录组学研究

作者：刘佳; 袁明; 贾茗雯; 郑洪伟; 姚静; 袁敏; 王静宇; 胡桃红^*

来源：航天医学与医学工程, 2018, 31(06): 583-589.

DOI：10.16289/j.cnki.1002-0837.2018.06.001

• 模拟失重
• 氧化应激
• 转录组测序
• 内皮细胞

目的探索回转模拟失重下EA.hy926细胞(人脐静脉内皮细胞与人肺腺癌细胞株A549的融合细胞)氧化应激后差异表达基因及其生物学意义。方法以EA.hy926细胞为研究对象,设置对照组(Con组)、对照氧化应激组(Con+H2O2)、模拟失重组(MG组)和模拟失重后氧化应激组(MG+H2O2组),采用Illumina Hi Seq 2500平台开展转录组测序,筛选差异表达基因;采用在线分析工具对差异基因进行Gene Ontology(GO)功能富集分析、KEGG信号通路分析以及STRING蛋白互作分析;以qRT-PCR技术验证筛选出的差异基因。结果测序结果表明,与Con组相比,MG+H2O2组差异基因253个;与Con+H2O2组相比,MG+H2O2组差异基因169个。GO及KEGG通路显著性富集分析结果显示,与Con+H2O2组相比,MG+H2O2组差异基因可显著富集于细胞因子刺激的细胞反应等生物过程及TNF等信号通路。蛋白互作分析表明CXCL蛋白处于互作的关键位置;qRT-PCR结果显示筛选的差异表达基因BCL-2A1、CXCL-8、FAM196B在各组间的表达变化与测序结果一致。结论模拟失重下氧化应激可诱导EA.hy926细胞产生不同的生物学反应,并通过调节BCL-2A1、CXCL-8、FAM196B基因表达对内皮细胞增殖、凋亡等生理功能发挥调控作用。

• 单位
  郑州市第二人民医院; 中国中医科学院广安门医院; 中国人民解放军第二炮兵总医院; 中国航天员科研训练中心; 锦州医科大学