基于生物信息数据分析miR-655-3p在肝癌中的表达及其可能的调控机制

作者：苏倩; 李小丽; 张忠山; 王栋洋^*

来源：邵阳学院学报(自然科学版), 2023, 20(05): 40-48.

• 肝癌
• miR-655-3p
• 生物信息
• 靶基因

目的 探讨miR-655-3p在肝癌(liver hepatocellular carcinoma, LIHC)中的表达及其可能参与的生物学过程和信号通路，为进一步研究miR-655-3p的调控机制及生物学功能提供理论依据。方法 初步分析miR-655-3p在肝癌中的表达情况；借助多个数据库预测并筛选靶基因，随后对获取的靶基因进行GO功能富集和KEGG富集分析；构建靶蛋白互作网络并筛选网络中的核心基因，最后验证分析核心基因在肝癌中的表达及它们与临床分期、预后的关系。结果 miR-655-3p在肝癌组织中呈低表达，经筛选获得miR-655-3p相关靶基因153个。这些靶基因主要与RNA聚合酶II启动子转录调控、血管发育、衰老、凋亡调控等生物学过程以及神经营养因子、Rap1、MAPK等信号通路相关。蛋白互作网络中筛选的10个核心基因，仅RAC1表达水平在LIHC组织中显著上调，且与肝癌患者的临床分期和总生存期(overall surviral, OS)相关。结论 miR-655-3p在肝癌相关的生物学过程中起重要作用，可能与筛选的靶基因RAC1表达上调有关。

• 单位
  湘南学院附属医院; 湘南学院