甘草生长素反应因子(ARF)基因家族的鉴定及表达分析

作者：关思静; 高静^*; 徐蓉蓉; 葛甜甜; 王楠; 颜永刚; 张岗; 陈莹; 刘阿萍; 程萌格

来源：中国农学通报, 2021, 37(29): 20-27.

• 乌拉尔甘草
• 生长素反应因子
• 系统进化
• 基因表达
• 表达模式分析

本研究旨在鉴定甘草ARF基因家族并分析其在非生物胁迫下的表达模式。以乌拉尔甘草(Glycyrrhiza uralensis Fisch.)为研究对象,利用生物信息学方法对ARF基因家族进行鉴定,并对其蛋白质理化性质、保守结构域、基因结构、进化关系、顺式作用元件和表达模式分析。鉴定得到10个甘草ARF基因。其蛋白氨基酸序列长度在301～945 aa之间,分子量约为33.07～104.37kDa,等电点为5.93～8.50。亚细胞定位分析显示甘草ARF蛋白均位于细胞核。保守结构域分析显示GuARF蛋白大多包含B3、Auxinresp和Aux/IAA结构域。基因结构发现外显子数量从6个到22个不等。在甘草ARF基因启动子区还存在5类不同的顺式调控元件。系统进化分析表明甘草ARF蛋白分为3类。转录组数据分析显示,10个GuARF基因在非生物胁迫下具有一定表达特异性。上述结果显示甘草ARF基因家族可能参与多种生物过程,这为进一步研究植物对非生物胁迫的生理和分子反应提供了有价值的信息。

• 单位
  陕西中医药大学