转录组鉴定‘三白’石榴品种籽粒发育相关差异表达基因

作者：骆翔; 曹尚银^*; 曹达; 李好先; 赵弟广; 张富红

来源：分子植物育种, 2018, 16(17): 5549-5560.

DOI：10.13271/j.mpb.016.005549

• 转录组
• 籽粒
• 石榴

为了研究石榴籽粒发育遗传机制及其在育种中的应用,以‘三白’石榴品种开花后60 d和120 d籽粒为试材,进行转录组测序分析。对表达差异基因进行GO注释及KEGG富集分析。结果分析表明,与‘三白’石榴开花后60 d籽粒相比,在开花后120 d籽粒中总共检测到8 409个显著差异表达基因;KEGG富集分析表明差异表达基因显著富集在激素信号转导及其它代谢产物的合成和代谢等18条代谢通路上;5类可变剪接类型中鉴定出了76个靶基因,其中17个为差异表达基因。定位到的差异表达基因可以为解析石榴籽粒发育以及基因克隆提供理论指导。

• 单位
  中国农业科学院郑州果树研究所