大型奶牛养殖环境源大肠埃希菌毒力基因与系统进化分群

作者：唐敏嘉; 张雪婧; 何卓琳; 蒲万霞^*

来源：中国兽医学报, 2022, 42(08): 1612-1619.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2022.08.14

• 大肠埃希菌
• 奶牛养殖环境
• 毒力基因
• 系统进化分群

对甘肃2个大型奶牛养殖环境的大肠埃希菌(Escherichia coli,E.coli)分离株进行系统进化分群和毒力基因分布情况研究，分析系统群与E.coli主要毒力基因之间的潜在关联，以期为E.coli的研究和防治提供参考。利用PCR方法对281株E.coli分离株进行系统进化分群鉴定和毒力基因检测。281株E.coli分离株被分为8个系统进化群，B1、A、E、F、D、C、B2群和隐支Ⅰ或Ⅱ的占比分别为51.96%,28.47%,11.39%,2.85%,1.78%,1.07%,0.71%,0.36%,有4株为未知系统群。毒力基因检测结果显示，ompA、ibeB、ompT、iroN、traT、iucD、fyuA和irp2的阳性率分别为100%,98.58%,76.16%,71.53%,68.33%,64.06%,30.96%,30.25%。不同年份和养殖环境的部分毒力基因的分布存在明显差异，携带8个所鉴定的毒力基因的菌株在B1、B2群和粪土源中的分布较多；traT在2017年的分布明显低于2018和2019年；traT和iroN在粪土源分离株中的分布高于污水源。系统群与毒力基因的关联性分析结果显示，A群与ompT和traT存在负相关性；B1群与ompT、irp2、fyuA和iucD存在正相关性；E群与irp2、fyuA和iucD存在负相关性，与iroN存在正相关性。系统进化分群以B1群为主，不同年份和养殖环境的部分毒力基因的分布有明显的差异；部分毒力基因的分布与系统群存在联系。

• 单位
  中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所