人参皂苷生物合成相关基因PgRg2BBE克隆及生物信息学分析

作者：李傲; 刘思章; 王义; 王康宇; 朱蕾; 李俐; 姜悦; 王艳芳

来源：吉林农业大学学报, 2023, 45(06): 693-701.

DOI：10.13327/j.jjlau.2022.1613

• 人参皂苷Rg2
• 生物合成
• PgRg2BBE
• 基因克隆
• 生物信息学
• 序列分析

克隆与人参皂苷Rg2合成相关的重要酶基因PgRg2BBE全长cDNA序列，并利用在线软件对该基因编码的蛋白质进行理化性质、结构域、亚细胞定位和系统进化等分析。结果表明：PgRg2BBE基因cDNA序列长为1 638 bp，编码545个氨基酸。PgRg2BBE蛋白分子量为60 967.10 u，等电点为8.88，不稳定性指数为34.04，预测该蛋白为一种稳定的亲水性跨膜蛋白，主要由α-螺旋和无规则卷曲组成。PgRg2BBE蛋白含有FAD＿binding＿4和BBE功能结构域，定位于叶绿体中，含有24个氨基酸序列信号肽。系统发育树分析发现，其与智利茄的亲缘关系最近，氨基酸序列多重比对发现，RgRg2BBE中含有4个保守基序，进一步与拟南芥AtBBE家族蛋白进行同源序列比对，发现它们同时具有4个保守基序（RKYGL、MGED、FWAIRGG、FPEI）。

• 单位
  国家中医药管理局; 吉林农业大学; 生命科学学院