m6A相关基因在宫颈癌中的表达及临床分析

作者：许修颖; 龚荣府; 杨娉娉; 方文^*

来源：基因组学与应用生物学, 2022, 41(01): 185-192.

DOI：10.13417/j.gab.041.000185

• 宫颈癌
• m6A修饰
• RBM15
• 生物信息学
• 预后

为探讨宫颈癌(cervical cancer, CC)中N6-甲基腺苷(m6A)修饰相关基因的表达及临床意义，从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中下载3个宫颈癌mRNA表达相关的数据集，筛选出m6A相关基因(METTL3、METTL14、METTL16、WTAP、KIAA1429、RBM15、ZC3H13、FTO、ALKBH5、YTHDF1/2/3、YTHDC1、HNRNPA2B1、HNRNPC)在宫颈癌中的表达情况。对RBM15进行生物信息学分析，利用UALCAN分析RBM15表达与临床病理特征的关系，LinkedOmics数据库用于RBM15相关共表达基因分析，STRING构建蛋白质相互作用网络，利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析RBM15与宫颈癌患者预后关系。GEO数据库差异分析结果显示RBM15在宫颈癌中的表达呈上升趋势(P<0.01),UALCAN分析RBM15表达与多个临床病理特征有关(P<0.05),LinkedOmics分析结果显示有460个基因与RBM15呈正相关，750个基因呈负相关(FDR<0.05),在STRING构建了RBM15蛋白质相互作用网络，生存分析结果显示RBM15基因低表达组的宫颈癌中位总生存时间高于高表达组的，但差异无统计学意义(HR=1.32,P=0.24)。本研究筛选了m6A相关基因在宫颈癌中的差异表达情况，并对RBM15进行生物信息学的分析，为RBM15在宫颈癌中的作用分析提供新的思路。

• 单位
  贵州医科大学