斑鸠霉素调节PANC-1细胞系的糖酵解过程

作者：陈辉; 曾陶飞; 厉泽宇; 王怀涛; 周磊; 谭晓冬^*

来源：医学研究生学报, 2022, 35(02): 147-153.

DOI：10.16571/j.cnki.1008-8199.2022.02.007

• 胰腺导管腺癌
• 斑鸠霉素
• 生物信息学分析
• 差异表达基因

目的 胰腺癌是恶性腹部肿瘤，以5年生存率奇低，致死率非常高为特征。文章基于生物信息学方法挖掘生物医学数据库数据，识别Ikarugamycin(斑鸠霉素)作用于胰腺导管腺癌(PDAC)的潜在靶标基因。方法 从基因表达汇编(GEO)数据库中下载数据集GSE120713,通过R软件对数据进行校正并鉴定差异表达基因(DEGs),绘制火山图和热图，并对鉴定出的DEGs进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析。然后，利用STRING网站和Cytoscape软件对DEGs进行蛋白质相互作用分析，借助Cytohubba插件识别出10个hub基因。最后，分别在GEPIA2和Kaplan-Meier Plotter网站上验证这些hub基因的表达及预后情况。结果 GEPIA2和Kaplan-Meier Plotter的结果提示：DDIT3、GADD45A、LOX、MMP1、SERPINE1和TXNIP同时满足在PC中表达及预后均有统计学意义，被确定为hub基因。结论 斑鸠霉素可能通过下调DDIT3或LOX的表达，参与PANC-1细胞系糖酵解过程，从而发挥对PANC-1细胞的抑制作用，该研究有助于发现斑鸠霉素治疗PDAC的潜在机制。

• 单位
  中国医科大学附属盛京医院