碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌毒力基因型及分子流行病学研究

作者：谢强; 徐添天; 谢瑞玉; 汤德刚^*

来源：热带医学杂志, 2023, 23(03): 327-280.

• 肺炎克霉伯菌
• 毒力基因
• 多位点序列分型

目的 分析本院碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌（CRKP）的耐药情况及毒力基因型及分子流行病学情况，为临床CRKP的抗感染治疗提供依据。方法 收集并鉴定滁州市第一人民医院2020年1-11月临床分离的非重复CRKP 28株。采用全自动微生物鉴定药敏分析仪VITEK-2 compact进行鉴定和药敏试验，使用全基因组测序技术（WGS）检测常见的毒力基因，采用多位点序列分型（MLST）和核心基因组多位点序列分型（cgMLST）对序列进行分析，并构建最小生成树（MST）。结果 28株CRKP对碳青霉烯类抗生素的耐药率为100.00%。WGS结果显示，CRKP主要毒力基因包括Ⅰ型菌毛[fimD(100.00%)]、Ⅲ型菌毛[mrkC(100.00%)]、耶尔森菌素[fyuA(89.29%)、irp1(75.00%)、irp2(75.00%)、ybtP(89.29%)、ybtQ(75.00%)]、大肠杆菌菌毛ECP[ecpD(92.86%)、ecpC(100.00%)]、肠杆菌素[fepA(100.00%)]、Pul[pulD(100.00%)]、SCI-I T6SS[ECABU＿c31030(78.57%)、APECO1＿3711(75.00%)、ECS88＿3097(71.43%)]。MLST分型显示，共有6个ST型，其中ST15型（20株，71.43%）为主要流行型，另有ST11型（4株，14.29%）,ST110(1株，3.57%),ST306(1株，3.57%),ST447(1株，3.57%),ST5328(1株，3.57%)。cg MLST分型和MST结果显示，CC1簇（16株，57.14%）为院内流行簇，另有CC2簇（3株，10.71%）和CC3簇（3株，10.71%）。结论 CRKP对碳青霉烯类抗生素的耐药率较高，同时携带大量的毒力基因，院内以ST15型为主要流行型，同时CC1簇在院内有小范围的播散。

• 单位
  安徽医科大学; 滁州市第一人民医院