龙虾科物种线粒体基因组特征和系统发育分析

作者：朱雷宇; 朱志煌; 朱陇强; 林琪^*

来源：中国水产科学, 2022, 29(04): 525-534.

• 龙虾科
• 线粒体基因组
• 结构特征
• 系统发育

综合分析了龙虾科(Palinuridae)13个物种线粒体基因组的全序列,发现其线粒体基因组的长度为15470～16105 bp, A+T含量为62.63%～67.11%。Ka/Ks分析表明,龙虾科中的10个龙虾属(Panulirus)物种线粒体13个蛋白质编码基因(protein-codinggenes,PCGs)的Ka/Ks<<1,显示出很强的纯化选择;在差异位点的分析中,发现nd5、nd4、rrnL基因的差异位点比例较高,是理想的分子标记,可用于分析龙虾类不同群体之间的遗传多样性;密码子偏好性分析表明,被编码的氨基酸偏好性是相似的。同时,本研究采用ML(maximumlikelihood)和BI(Bayesian inference)方法构建系统发育树,结果显示,塔斯马尼亚龙虾属(Sagmariasus)物种最先开始分化,而龙虾属单独聚为一支,且与脊龙虾属(Linuparus)/游龙虾属(Puerulus)互为姊妹关系。贝叶斯分子钟估算结果显示,龙虾科物种可能起源于三叠纪,随后进一步分化为具有现代表征的龙虾种类。本研究旨在为快速鉴定龙虾科生物提供可靠的分子标记,并为分析龙虾科物种遗传多样性提供理论依据。

• 单位
  福建省水产研究所; 上海海洋大学; 生命学院