利用GEO结肠癌芯片数据分析FOXC1及其相关基因的表达与意义

作者：马红梅; 刘曙光^*; 许伟珊

来源：国际医药卫生导报, 2018, 24(23): 3535-3538.

• 结肠肿瘤
• 基因表达
• FOXC1
• 基因芯片

目的探讨叉头框C1 (forkhead box C1, FOXC1)在结肠癌的表达水平与临床病理特征及预后的关系,并分析预测与其表达密切相关的基因及其参与的生物过程。方法利用高通量基因表达(Gene expression omnibus, GEO)数据库中结肠癌基因芯片数据分析FOXC1与临床病理特征及预后的相关性,采用R2平台,筛选出与FOXC1表达显著相关的基因进行基因本体(Gene Ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书通路分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路分析。结果FOXC1的表达与肿瘤分化程度有关(x2=7.919,P=0.019)。Kaplan-Meier法分析显示FOXC1的表达与患者的总生存期有相关性(P=0.045)。采用R2平台检测出与FOXC1表达显著相关基因共608个(其中正相关387个、负相关221个),对GO及KEGG通路分析后发现FOXC1高表达的肿瘤样本富集到其中564相关基因,主要涉及到血管生成、细胞增生、凋亡、细胞粘附、蛋白磷酸化信号传导、转录因子结合和上皮间质转化等多个肿瘤发生、发展过程。肿瘤信号通路主要涉及Wnt信号通路。结论 FOXC1表达在结肠癌中是一种不良预后因素,可作为判断预后的标志物。FOXC1表达相关的基因参与了多个结肠癌生物过程和信号通路,可为结肠癌分子标志物的深入研究提供参考。

• 单位
  中山大学附属第八医院（深圳福田）