牛源致脑炎大肠杆菌FimD、PilN蛋白的生物信息学分析和优势B细胞表位预测

作者：海永慧; 钦倩; 李蓓蓓; 任静静; 马勋; 蒋建军^*; 王鹏雁^*

来源：中国兽医杂志, 2022, 58(03): 9-133.

• 牛源致脑炎大肠杆菌
• FimD蛋白
• PilN蛋白
• 生物信息学分析
• B细胞抗原表位

为了筛选出牛源致脑炎大肠杆菌S9922 FimD、PilN蛋白的优势B细胞表位，本试验采用生物信息学分析工具ProtParam、TMHMM、NetPhos、DNASTAR软件、SOPMA、SWISS-MODEL、BepiPred、Immunomedicine Group等对FimD、PilN蛋白进行理化性质、跨膜区、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点、二级结构、三级结构和B细胞表位预测，并进行综合分析，最终得出优势B细胞表位。结果显示，FimD、PilN蛋白都为亲水、稳定蛋白，无规则卷曲在二级结构中所占比例最高；FimD蛋白共有48个磷酸化位点，不存在跨膜区和信号肽；PilN蛋白共有85个磷酸化位点，PilN蛋白在1～50位氨基酸上可能出现跨膜区，26～27位氨基酸上出现信号肽；多种参数综合分析最终得到潜在的优势B细胞表位，FimD蛋白：7～18、144～152、307～315、365～373;PilN蛋白：77～86、138～149、516～524。通过对FimD、PilN蛋白进行综合分析，最终得出潜在的优势B细胞表位，为牛源致脑炎大肠杆菌多表位疫苗的进一步研究提供参考依据。

• 单位
  动物科技学院; 石河子大学