采用分子动力学模拟方法研究Ca~(2+)和R1597W突变对VWF-A2构象稳定性的影响

作者:谢旭斌; 刘文平; 吴建华; 方颖
来源:中国力学学会中国生物医学工程学会生物力学专业委员会、中国生物物理学会生物力学与生物流变学专业委员会, 中国陕西西安, 2018-08-17.

摘要

<正>目的ADAMTS13通过酶切VWF-A2结构域内隐藏的肽键(TYR~(1605)-MET~(1606))调控VWF多聚体的尺寸,进而调控其止血潜能,该过程不仅与A2稳定性有关,还受到血流剪应力的调节。从原子水平揭示Ca~(2+)和2A型R1597W突变对VWF-A2结构稳定性及解折叠路径的影响。方法 对不含Ca~(2+)(PDB ID:3GXB)和含Ca~(2+)(PDB ID:3ZQK)的A2晶体结构及计算机突变得到的相应突变体R1597W-A2和R1597W-A2/Ca~(2+)分别进行热平衡和拉伸分子动力学模拟;比较分析Ca~(2+)结合和R1597W引起的构象稳定性变化、局部动...