植物乳杆菌PC518质粒pLP224的发现以及pMV158家族质粒的保守性和多样性分析

作者：苟秋凤; 许晓羽; 姚芳; 谢拥军; 代富英; 潘渠^*

来源：微生物学通报, 2020, 47(12): 4309-4316.

DOI：10.13344/j.microbiol.china.200017

• 植物乳杆菌
• 质粒
• 滚环复制
• pMV158家族
• Rep蛋白
• 结合序列

【背景】植物乳杆菌含有丰富的天然质粒,分析这些质粒的序列特征有利于分析质粒所携带的遗传信息。【目的】分析从植物乳杆菌PC518分离的新质粒pLP224,聚类分析其所属家族质粒的保守性与多样性。【方法】提取植物乳杆菌PC518的质粒,酶切后构建质粒DNA文库,测序和BLAST鉴定文库中的新序列;通过反向PCR完成质粒全序列测定,注释新质粒;使用进化树软件MEGA X构建质粒的Rep蛋白进化树,并分析结合序列的变化。【结果】从植物乳杆菌PC518分离出一个质粒pLP224,大小为1766bp,其中(G+C)mol%含量为41.39%,与已知质粒的最大序列相似性为86.85%。推定其复制方式为滚环复制,属于pMV158家族成员。17个pMV158家族质粒的Rep蛋白分析表明:pMV158家族质粒的Rep蛋白进化距离越近,其dso位点的结合序列相似性越高,进化距离越远则其序列相似性越低。【结论】pLP224是pMV158家族的新成员。pMV158家族质粒在dso位点的切开序列上保守,在结合序列上多样。其Rep蛋白随结合序列变化而不同。这种差异有利于pMV158家族不同成员在同一宿主的共存,是家族成员持续存在并稳定进化的基础。

• 单位
  成都医学院; 基础医学院